у меня такие предположения:
1. одноядерник в силу своей слабости был слабым звеном в системе и видяха не была загружена полностью, поэтому не перегревалась
2. одноядерник выделяет меньше тепла, чем двухядерник. Банальное повышение температуры в корпусе приводит к перегреву
3. поменяйте термопасту на ядре видеокарты. Скольков корпусе кулеров работает на вдув/выдув воздуха?