объясните мне почему с ручной подачи все цвета на месте?
Загадка... Между ручной подачей и подачей из лотка вообще нет никакой разницы...
Давайте фантазировать: лист по идее должен "прилипнуть" к полотенцу на входе, пройти четко без смещений под всеми картриджами, и отлипнуть только перед печью. Если предположить, что все лучи светят ровно как положено, то значит лист в процессе прохождения под лучами как-то смещается... Сделайте с десяток подряд отчетов из лотка и проверьте, одинаково ли на всех виден рассинхрон? А потом, кстати, с десяток отчетов из ручной подачи подряд. Это даст мысли где искать - в механике, в электронике или в оптике... Я заметил, что рассинхроны у меня случались только на тех машинах, где чистился блок лазеров...