Привет!
Не понятно, что произошло, но!
Обычно, при запуске дистрибутива при уже существующей Windows, спрашивает - что будем делать - устанавливать дополнительный экземпляр Windows (полетят все настройки!) или восстанавливать существующий. Есть риск все раздербанить.
Поэтому мой совет - обратиться к профессионалу, т.к. перед такого рода действиями обычно делается "слепок" существующей системы, чтобы можно было "откатиться" назад, причем штатные средства (backup) слишком слабы, потому используются специализированные средства типа Acronis True Image.